Su puerto comercial está clasificado de interés nacional, por el elevado tráfico de mercancías que tiene, tanto a nivel nacional como internacional. De aquí parten los ferrys de pasajeros que comunican Trapani con las islas Egadi, Ustica y Pantelleria, así como barcos hacia el norte de Africa y terminal de cruceros.
El puerto de Trapani se halla en el extremo sur de la ciudad y está considerado uno de los más seguros de Sicilia. Sus dimensiones son impresionantes: 921.000 metros cuadrados. Está dividido en tres zonas: comercial, pesquera y deportiva.